我与中国的美丽邂逅（3）：热爱科研学业有成

基肖尔·库马尔·萨克（Kishor Kumar Sarker，中文名：唐骏），孟加拉国人，2019年获中国政府奖学金项目资助来到上海海洋大学留学，在水产与生命学院李晨虹教授课题组攻读博士学位。他研究的对象是孟加拉国的国鱼——孟加拉鲥（Tenualosa ilisha）。孟加拉鲥（Tenualosa ilisha）和美洲鲥（Alosa sapidissima）同为鲱形目鲱科，但一个生活在热带（Tenualosa ilisha），另一个生活在温带（Alosa sapidissima），却都进化出相似的生物学性状和溯河洄游习性。在读期间，他研究了美洲鲥和孟加拉鲥之间的平行进化关系，并对现存鲱形目代表物种的基因组和转录组数据进行了生物信息学分析，在读博期间，累计发表SCI论文11篇。

克服困难，学业有成

唐骏硕士专业是渔业，生物信息分析对于他来说是完全陌生且富有挑战性的。除了学术上的挑战，初来乍到的陌生环境对他的日常生活和工作也造成了不小的障碍，比如刚来时语言上不通，如何登录选课系统都很困难，但来自导师、实验室伙伴的支持和关心，以及他接受挑战和学习新事物的决心，使他一直保持着前进的步伐。

经过三年的学习，唐骏在问题设计、实验室技术、科学写作和与国际学术界的交流方面都获得了不小的提升。在BMC Genomic Data上首次发表一篇美洲鲥鱼（A. sapidissima）转录组从头组装和注释的文章，关于鲱形目鱼类洄游生活史分子机制与平行进化的几篇文章也正在撰写发表中。通过大量的数据分析，他掌握了比较基因组学、群体遗传学与分子系统学的专业知识，在其他重要的学术期刊上合作发表了多篇文章，如《Molecular Phylogenetics and Evolution》上的鲱形目系统发育解析，《Scentific Reports》上的孟加拉鲥群体遗传学研究，《Journal of Heredity》上对濒危老挝鲥鱼基因组的组装等等。此外，他对生态毒理学领域也有涉猎。他是第一个追踪孟加拉国唯一的珊瑚岛 - 圣马丁岛生物重金属污染的人。这项特殊的工作发表在《Environmental Science and Pollution Research》上。他和团队还首次证实了孟加拉鲥（Hilsa shad）体内有毒元素的存在，这项研究发表在Q1期刊《Environmental Toxicology and Pharmacology》上。

热爱科研，融入团队

唐骏对周遭的事物总能保持极大的热情，乐于探索，这也是受他的博士导师李晨虹教授的启发，因为李老师总是鼓励他：“没有愚蠢的问题”、“当一件事没人知道答案，这就是一个值得去探究的科学问题”。当遇到自己无法独立解决的问题时，他总会向实验室的伙伴请教。他也乐于帮助别人，是实验室团队中重要的一员，大伙都亲切地叫他“老K”。2022年在上海海洋大学博士毕业后，Kishor决定继续从事博士后研究。他希望通过基因组学来研究鲥鱼洄游的分子机制，并为所有的鲥鱼物种建立一个参考基因组库，期望最终能够借助这些信息和未来的技术手段，“找回”已经灭绝了的中国鲥鱼（T. reevesii）。

科研成果

口头报告：

1. KK Sarker*，陆亮，李晨虹， “De novo assembly and annotation of muscle transcriptome of the American shad (Alosa sapidissima) provides insights into lipid synthesis mechanism for migratory fishes”。中国动物学会、中国海洋湖沼学会鱼类学分会学术研讨会，2021，10月22-24，重庆。

论文：

2. Sarker KK, Lu L, Huang J, Thou Z, Wang L, Hi Y, Jiang L, Naher H, Baki MA, Sarker A, Li C (2022) First report of de Novo assembly and annotation from brain and blood transcription of an anadromous shad, Alosa sapidissima. BMC Genomic Data, 23(1):22

3. Sarker KK, Bristy, MS, Sultana I, Khandakar N, Islam S, Baki MA, Das DK (2021) Diversity and conservation status of fish in the Nijhum Dweep National Park, Bangladesh. Journal of Fisheries, 9(2): 92206.

4. Sarker KK, Bristy MS, Alam N, Baki MA, Shojib FH, Quraishi SB, Khan MF (2020). Ecological risk and source apportionment of heavy metals in surface water and sediments on Saint Martin's Island in the Bay of Bengal. Environmental science and pollution research, 27(25):31827–31840. https://doi.org/10.1007/s11356-020-09384-x

5. Jiang L, Zhou M, Sarker KK, Huang J, Chen W, Li C (2022). Mitochondrial genome uncovered hidden diversity in Microdous chalmersi, (Teleostei: Odontobutidae) (Accepted in Mitochondrial DNA Part B).

6. Wang L, Lu L, Sarker KK, Li C (2022) A high-quality genome assembly of the Laotian shad (Tenualosa thibaudeaui), an endemic species of the Mekong River Basin. Journal of  Heredity, esac058. https://doi: 10.1093/jhered/esac058 PMID: 36223282

7. Wang Q, Dizaj LP, Huang J, Sarker KK, Kevrekidis C, Reichenbacher B, Esmaeili HR, Straube N, Moritz T, Li C (2022). Molecular phylogenetics of the Clupeiformes based on exon-capture data and a new classification of the order. Molecular Phylogenetics and Evolution, 107590. https://doi: 10.1016/j.ympev.2022.107590 

8. Huang H, Jiang J, Cheng F, Sarker KK, Kim J, Li C (2022). Range-wide population genetics of the tapertail anchovy Coilia nasus based on exon capture data. Marine Biodiversity, 52:43. https://doi.org/10.1007/s12526-022-01283-3

9. Hu Y, Lu L, Zhou T, Sarker KK, Huang J, Xia J, Li C (2021). A high-resolution genome of an euryhaline and eurythermal rhinogoby (Rhinogobius similis Gill 1895). G3 (Bethesda, Md.), jkab395.  https://doi.org/10.1093/g3journal/jkab395

10. Sarker A, Jiang J, Naher H, Huang J, Sarker KK, Yin G, Baki MA, Li C (2021). Cross-species gene enrichment revealed a single population of Hilsa shad (Tenualosa ilisha) with low genetic variation in Bangladesh waters. Scientific reports 11(1):11560. https://doi.org/10.1038/s41598-021-90864-6

11. Bristy MS, Sarker KK, Baki MA, Quraishi SB, Hossain MM, Islam A, Khan MF (2021). Health risk estimation of metals bioaccumulated in commercial fish from coastal areas and rivers in Bangladesh. Environmental toxicology and pharmacology, 86:103666. https://doi.org/10.1016/j.etap.2021.103666

12. Sarker A, Naher H, Junman H, Sarker KK, Baki MA, Li C (2020). Genetic diversity of Hilsa kelee collected from the Bay of Bengal and the Arabian Sea. Marine Biodiversity 50:94. https://doi.org/10.1007/s12526-020-01114-3 

（供稿：水产与生命学院、国际文化交流学院）